Mit cygwin (ich nehme an du arbeitest unter Windows?) gibt es da meines Wissens manchmal Probleme mit den Zugriffsrechten auf den Ordner.
Evtl. lässt sich das lösen, indem du den Patcher nochmal neu in ein anderes Verzeichnis extrahierst.

Seit einem Update von 2014 verhält sich Cygwin gelegentlich merkwürdig: Die angelegten Dateien gehören einem nicht selbst. Und dann darf man diese Dateien nicht mehr löschen und -- was viel schlimmer ist-- teilweise nicht mehr nutzen.

In meinen Tests hat mir nur eines geholfen:
Die Rechte-Verwaltung des übergeordneten Ordners (=Basisordner) öffnen und dann:

1.) Sich selbst zum Besitzer inkl. der untergeordneten Order+Dateien machen.
2.) Sich selbst alle Rechte geben inkl. der untergeordneten Order+Dateien machen.
Seitdem ich dieses gemacht habe und ich alle neuen Projekte in diesem Basisordner anlege, habe ich keine Probleme mehr gehabt.