Verkleinern kannst du diese auch mit DMLToolkit welches von mir entwickelt wurde. Allerdings müssen bei allen drei Programmen die spiele im iso format vorliegen damit du sie verkleinern kannst.

DMLToolkit und DMLizzard sind beide mit Nintendont kompatibel auch wenn sie ursprünglich für DIOS MIOS gedacht sind. Bei DMLToolkit nimmst du beim konvertieren die Option mit DiscEx Konvertieren und dann mit Komprimierung allerding laufen einige Spiele komprimiert sind ein bekanntes Spiel ist zum beispiel Windwaker.

Edit: Hier der Downloadlink zu DMLToolkit: DMLToolkit

Nächstes jahr folgt noch ein Update dann kann man mit DMLToolkit auch immer die aktuellste Nintendont version downloaden.

Kleiner Hinweis: DMLizard unterstützt neben ISO auch GCM Images und bietet eine Stapelverarbeitung, d.h. einmal alle Spiele in die Liste packen und dann warten, bis es ganz fertig ist.
Außerdem bietet es sowohl DiscEx als auch GCReEx als Ausgabeformate an - für Nintendont (und generell) empfehle ich DiscEx, denn GCReEx spart vielleicht wenige KiloByte bis MegaByte pro Image, aber dafür hat man statt einer ISO am Ende alle Dateien entpackt. Gerade bei einer Clustergröße von 32KB ist das somit wohl eher sogar nachteilig und verbraucht mehr Speicher, aber auch die Handhabung und der Kopiervorgang auf die Festplatte sind deutlich unangenehmer.

DM Toolbox gäbe es m.W. auch noch und bietet eine einfach zu bedienende Windows-Oberfläche.

Dann nutze DMToolbox oder Rechtsklicke die Datei mit gehaltener Shift-Taste und wähle "Pfad kopieren" -> im DMLizard "Einfügen". Das Problem tritt bei einigen Windows-Installationen auf und liegt nicht am DMLizard selbst.

Dies geht übrigens auch bei DMLToolkit und jeder anderen Konsolenanwendung.