Der WiiFlow Configurator ist ein PC-Tool für Windows-Betriebssysteme mit dem man Einstellungen für den WiiFlow USB Loader bequem am Rechner vornehmen kann. Deutsche Sprache ist mit enthalten. Es wird mindestens .NET Framework 2.0 benötigt. Nach dem Speichern wird eine categories.ini erstellt, die im Verzeichnis /wiiflow/settings unterzubringen ist.